伊賀上野赤坂(三重県上野市)で松尾与左衛門の次男として生まれる。
当時は「農人町」という町名だった。父松尾与左衛門は伊賀土豪の末裔の郷士、苗字帯刀を許されていたが無給の「無足人」(むそくにん)という家系。
幼名は金作、後に藤七郎、甚七郎、忠右衛門と称した。名は宗房(むねふさ)。
上に兄半左衛門と姉が一人、下に妹が3人いた。

1637年（寛永14）島原の乱、五人組の規定
1649年（慶安2）慶安の御触書
1651年（慶安4）由比小雪の慶安事件
1657年（明暦3）大火で江戸城本丸・二の丸をはじめ江戸の半ばが焼ける
徳川光圀が『大日本史』の編纂を始める
1660年（万治3）仙台藩伊達騒動

藤堂新七郎家（侍大将5千石）の良精(よしきよ)の息子良忠(よしただ)(俳号蝉吟(せんぎん))に仕える。なぜ郷士の子が採用されたかは不明。役職は「台所用人」＝料理人だが、採用当初は良忠の近習、俳諧仲間だったようだ。「台所用人」という役職は、良忠死去後の役職で、生前は近習といったところか。
芭蕉は、忠右衛門宗房と名のる。芭蕉は良忠に仕えたことから、四書五経や漢詩など当時としては高度な武将としての教育をともに受けたのではないかといわれているが、詳細は不明。

俳諧の宗匠として立机。立机披露の万句興行を催す。桃青一門の確立を目指す。
「書き役」という仕事と俳諧の宗匠、内縁の寿貞。芭蕉の好調な日本橋での生活。

6月、仏頂和尚は、土地をめぐる鹿島神宮との争いに勝訴したが、住職をしていた根本寺を弟子に譲り、行脚の旅に出たようだ。芭蕉の胸に、仏頂和尚の行脚修行の旅の生き方が肝銘として残ったのではないか。
「芭蕉」の俳号を初めて使用する。
以降も「ばせを」や「芭蕉(庵)桃青」、「風羅坊芭蕉」、「泊船堂芭蕉」などの名を使っている。
12月、江戸駒込大円寺を火元とする江戸大火(八百屋お七の「お七火事」)により芭蕉庵消失。火宅・無常・無所住の心。
人を頼って甲斐へ。
「笠はり １」（「世にふるも」句文）
花にうき世我酒白く食(めし)黒し
氷苦く偃鼠(えんそ)が喉(のど)をうるほせり
あさがほに我は食くふおとこ哉
世にふるもさらに宗祇（そうぎ）のやどり哉

８月、門人千里を伴って「野ざらし紀行」の旅に出る。帰郷して母の供養。
東海道を経て伊勢神宮外宮参詣。大垣・桑名・熱田・名古屋に滞在。
名古屋で歌仙「冬の日」を巻く。連衆は、芭蕉・野水・荷兮・重五・杜国・小池正平。蕉風の確立。
「馬に寝て」の詞書、「狂句こがらしの」の詞書
野ざらしを心に風のしむ身かな
霧しぐれ富士をみぬ日ぞ面白き
道のべの木槿（むくげ）は馬にくはれけり
馬に寝て残夢月遠し(残夢残月)茶のけぶり
手にとらば消えん涙ぞあつき秋の霜
露とくとく心みに浮世すすがばや
秋風や藪（やぶ）も畠も不破の関
しにもせぬ旅寝のはてよ秋の暮
明けぼのやしら魚白きこと一寸
狂句こがらしの身は竹斎に似たる哉　（歌仙「冬の日」の発句）
海くれて鴨のこゑほのかに白し
年くれぬ笠きて草鞋はきながら
たび寝して我句をしれや秋の風

井原西鶴『好色五人女』
芭蕉庵で蛙の句の句合「蛙合」。
「古池や蛙飛こむ水のをと」ができる。
「雪丸げ」の詞書
東にしあはれさひとつ秋の風
名月や池をるぐりて夜もすがら
君火をたけよきもの見せむ雪まるげ
酒のめばいとど寝られぬ夜の雪
月雪とのさばりけらしとしの昏

柳沢吉保が側用人に。
井原西鶴『日本永代蔵』
2月、杜国と落合い伊勢神宮参拝。吉野、高野山、和歌の浦、奈良、大阪、須磨、明石、京都、ここで杜国と別れる。その後、京都、岐阜、鳴海・名古屋遊ぶ。
8月、越人と信濃路「更科紀行」の旅、姥捨てに向かう。
芭蕉庵で「深川八貧」の句会。
「夏はあれど」の詞書、「蛸壺や」の詞書、「おもかげや」句文、更級姥捨月之弁
二日にもぬかりはせじな花の春
何の木の花とはしらず匂哉
はだかにはまだ衣更着(きさらぎ)の嵐かな
此山のかなしさ告げよ野老堀(ところぼり)
さまざまのこと思い出す桜かな
花の陰謡(うたひ)に似たる旅ねかな
若葉して御目の雫ぬぐわばや
ほろほろと山吹ちるか瀧の音
さびしさや華のあたりのあすなろう
日は花に暮れてさびしやあすなろう
父母のしきりに恋し雉(きじ)の声
行春にわかの浦にて追付たり
草臥(くたび)れて宿かる比や藤の花
月はあれど留主のよう也須磨の夏
蛸壺やはかなき夢を夏の月
面白うてやがて哀しき鵜舟（鵜飼い）哉
たびにあきてけふ幾日やら秋の風
粟稗(あわひえ)にまづしくもなし草の庵
かけはしやいのちをからむ蔦かづら
おくられつおくりつはては木曽の秋
俤(おもかげ)や姥ひとり泣月の友
いさよひもまだ更科の郡哉
身にしみて大根からし秋の風
吹き飛ばす石はあさまの野分哉
冬籠りまたよりそはん此のはしら

1月伊賀上野に帰郷。
3月義仲寺の無名庵に滞在。
４月〜７月まで国分山の幻住庵に暮らし「幻住庵の記」を書く。
6月京都に出て凡兆宅に滞在。幻住庵に戻る。
伊賀に帰るが、12月には大津の乙州の新宅に滞在する。
「ひさご」(珍硯（ちんせき）が編集、観念を排して具体的な描写。「かるみ」を志向。)出板。
薦(こも)を着て誰人います花のはる
木のもとに汁も鱠(なます)も桜かな
行く春を近江の人と惜しみける
先たのむ椎の木も有り夏木立
病雁の夜さむに落ちて旅寝哉
乾鮭(からさけ)も空也の痩せも寒の中(うち)

桃印、芭蕉庵にて没。
「許六離別の詞」(柴門の辞) 「閉関の説」を草す。
芭蕉の体調がおもわしくない。
昆若(こんにゃく)にけふは売勝(うりかつ)若菜哉

この年、しきりに「軽み(かるみ)」を提唱する。「炭俵」(新しい門人の野坡、利牛、孤屋が編集。「かるみ」表現。)出板。

「おくのほそ道」完成。元禄二年に「おくのほそ道」の旅に出てから５年の歳月がたっていた。完成はしたが出版されるのは、芭蕉没後８年たった元禄十五年だった。芭蕉は「おくのほそ道」を出版して世に問う気持ちがあったのかどうか。

伊賀上野に帰り、「おくのほそ道」の清書版を兄に渡す。
5月伊賀上野をへて、大津膳所へ。
6月　芭蕉の内縁の妻、寿貞が芭蕉庵で死去。寿貞の死を知らせる手紙を京都嵯峨の落柿舎で受け取る。
義仲寺の無名庵へ。
９月８日、「続猿蓑」を遂げた芭蕉は、支考や江戸から戻っていた二郎兵衛とともに、大坂(大阪)に向けて伊賀上野を旅立った。出発当日の８日は奈良に一泊し、翌日大坂に到着した。
９月10日の晩、芭蕉は悪寒・頭痛に襲われ、この日から10日間ほど同じ症状を繰り返した。
芭蕉は病を押して９月26日から28日まで３日連続して俳席に連座した。「秋深き隣は何をする人ぞ」(28日吟)を発句として芝柏亭俳諧が行われることになっていた29日の夜、下痢のために床に臥し、この日を境に次第に容態が悪化していった。

大阪の酒堂(しゅどう:珍碩)と之道(しどう)の争いの調停、失敗。

10月に入ると病状はいよいよ差し迫り、芭蕉は之道亭から花屋仁左衛門の貸座敷に移され、膳所、大津、伊勢などの門人に急が告げられた。
８日の夜更け、病中吟「旅に病んで夢は枯野をかけ廻る」を示すなどの気力も見せたが、翌々日の10日になって、暮方から様態が急変した。死に際を悟った芭蕉は、同日、兄半左衛門宛に自らの手で遺書を認めた後、門人たちへの遺書を支考に代筆させた。

10月11日、朝から食を断って不浄を清めていた芭蕉のもとへ、上方の旅先から其角が駆けつけた。その夜、芭蕉は永久の別れを直ぐにして門弟たちの夜伽の句を耳に残し、翌12日申の刻(午後４時ごろ)、51歳でその生涯を閉じた。
10月12日、芭蕉逝く。
同日夜、芭蕉の遺言通り義仲寺に葬るため、去来・基角・乙州・支考・丈草・惟然・正秀・木節・呑舟・二郎兵衛の十人が、遺骸とともに淀川をさかのぼった。
13日午後 柩を膳所義仲寺に運び、14日境内に埋葬。

むめががにのつと日の出る山路かな
前髪もまだ若草の匂ひかな
蕎麦はまだ花でもてなす山路かな
ひやひやと壁を踏まえて昼寝かな
数ならぬ身となおもいそ玉祭り
菊の香やならには古き仏達
秋深き隣は何をする人ぞ
此道や行人なしに秋の暮
この秋は何で年よる雲に鳥
物いへば唇寒し秋の風
旅に病んで夢は枯野をかけ廻(めぐ)る

＜年齢不詳＞
西行の庵もあらん花の庭
ほととぎす今は俳諧師なき世かな
白菊よ白菊よ恥長髪よ長髪よ
子に飽くと申す人には花もなし
魚の骨しはぶる迄の老を見て
奈良七重七堂伽藍八重ざくら